○リフトに乗って下のエリアへ進みます。まず最初に行うことはビリーの救出ですのでマップ上赤字のビリー気絶中のポイントまで進んで下さい。到着すれば再びビリーと行動出来るようになります。
○ビリーと合流後、まずは地下７階の水槽室へ行きます。ここで２人で協力して木箱パズルを解いて下さい。「@バルブハンドル」入手。※木箱の一つはビリーでないと押せない為、木箱の移動はビリー、水の管理はレベッカで行います。
○「@バルブハンドル」にてポンプ地下層へ進みます。
○ポンプ地下層からポンプ室上層へはレベッカが赤い薬品を採取しにいくのみです。
○処理場宿舎へ進みます。ここでは多量のアイテムやセーブポイントがありますので利用しましょう。さらに進み、ゴンドラのある電源兼空気調整室を通り最終処理室へ進みます。すると「プロトタイラント」が出現しますのでがんばって倒して下さい。倒せば上のフロアへ進む為の階段スイッチを押せるようになります。上のフロアへ進んだら「Aコンピュータの基盤」を入手して電源兼空気調整室（ゴンドラのある場所）まで戻ります。
○ゴンドラの操作盤に「Aコンピュータの基盤」をセットし、レベッカにゴンドラに乗り込んでもらいます。
○ゴンドラ到着地点のダム管理塔から第１研究室へ行くと「プレイグクローラー」がいますので倒してしまいましょう。この部屋にて「青い薬品」を採取して「硫酸」を作って下さい。そして同室内にあります「B工業用水」と合わせて「バッテリー液」を作ります。もう一つ同室内から掛かっている内カギを解除してビリーと合流させて下さい。
○ビリーと合流できたら第２研究室の棚上にあるアイテムを、パートナーと協力して「C高出力バッテリー」を入手して下さい。その後ムービー。「C高出力バッテリー」と「バッテリー液」を組み合わせておきましょう。
○庭へ進みます。どちらでも良いのでフォークリフトの木箱上に載り、パートナーが「C高出力バッテリー」と「バッテリー液」を組み合わせたアイテムをフォークリフトに使用しスイッチを押せば、リフトを上げ「Dカードキー」を入手出来るようになります。「Dカードキー」を入手したら連絡通路へ向かいます。
○「Dカードキー」を使用し、先の部屋、マイクロ波焼却炉室へ進みましょう。室内に入ると「女王ヒル第一形態」と戦闘になります。勝利すれば「Eパイロット坑のカギＬ」「Fパイロット坑のカギＲ」が入手出来るようになります。２つのアイテムをそれぞれのキャラがが持って搬入口へ進んで下さい。
○搬入口、ラスボス戦前ですのでアイテムやセーブポイントがあります。十分装備を整えて倉庫へ進んで下さい。
○リフトで倉庫へ移動すると「女王ヒル第二形態」との戦闘です。第二形態を倒すことは出来ませんが、一定のダメージを与えるとムービーが入り、レベッカは倉庫内に日光を入れるためゲートを開く作業を行うようになります。ビリーを操作して女王ヒルを引き付ける役目をして下さい。レベッカが全てのゲートを開けばエンディングです。
